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病原监控专题 | 仅需一分钟手工操作!轮状病毒感染性腹泻监测且看伯杰

2022-08-15
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病毒性腹泻是由病毒感染引起的急性肠道传染病,以恶心、呕吐、腹痛、腹泻(排水样便或稀便)为主要临床症状。轮状病毒(Rotavirus,RV),诺如病毒(Norovirus,NoV),札如病毒(Sapovirus,SaV),星状病毒(Astrovirus,AsV)和肠道腺病毒(Adenovirus,AdV)是导致病毒性腹泻及暴发疫情的主要病原。其中A组轮状病毒(RVA)是引起全球婴幼儿重症腹泻的最重要病原之一[1]RVA感染所导致的腹泻给全球婴幼儿带来了巨大的疾病负担


RVA属于呼肠孤病毒科轮状病毒属是一种无包膜的双链RNA病毒,其基因由11段双链RNA节段组成,编码6种结构蛋白(VP1、VP2、VP3、VP4、VP6和VP7)和6种非结构蛋白(NSP1、NSP2、NSP3、NSP4、NSP5 和NSP6)[2]


轮状病毒的命名根据VP7和VP4核苷酸差异分别建立了G基因型和P基因型的双重命名系统,迄今为止,全球已从人类和各种动物中发现41个G基因型和57个P基因型。人类最常见的G基因型是G1、G2、G3、G4、G9和G12最常见的P基因型是P[4]、P[6]和P[8][2-3]。其中有6种基因型G1P[8]、G2P[4]、G3P[8]、G4P[8]、G9P[8]和G12P[8]导致全球90%以上的人类RVA相关腹泻[3-5]


我国RVA基因型的多样性和普遍性也值得关注[6]

  • 2016-2017年厦门地区G基因分型结果显示:G9为主要基因型(占69.4%),其次是G2(占5.1%),G1占4.1%,G3占1%;P基因分型结果显示:P[8]为主要基因型(占75.5%),P[4]占5.1%。G/P组合基因型G9P[8]为主要基因组合型(占64.3%),其次是G2P[4](占5.1%)。


  • 2017-2018年,上海主要型别是G9P[8](67.96%),其次是G3P[8](15.49%)和G1P[8](12.32%)。同时期杭州地区的分子流行病学研究显示,在228例RVA阳性标本中,G9P[8](84.6%,193/228)是该地区最优势的基因型,其次是G3P[8](8.8%,20/228)、G2P[4](3.1%,7/228)、G1P[8](2.6%,6/228)和G9P[4](0.9%,2/228)。


  • 2015-2019年山西省961名10岁以下儿童中19.0%RVA呈阳性,其中G9P[8]最常见(76.0%),其次是G3P[8](7.1%)、G2P[4](3.3%)、G1P[8](0.5%)和G9P[4](0.5%)。


  • 2018-2019年湖北省G基因型主要为G9型(86.84%),P基因型主要为P[8]型(79.37%);G基因型和P基因型组合有5种,以G9P[8]型(86.84%)为主要基因型。


近年来,G9P[8]基因型已经成为我国最主要流行优势基因型,该基因型是否一直保持流行还需要进行长期监测。中国疾病预防控制中心印发的《全国病毒性腹泻检测方案(2021版)》指出:我国各病毒性腹泻监测点应对5岁以下腹泻住院患儿开展A组轮状病毒抗原检测及阳性标本基因分型,对14岁及以上人群腹泻住院和门诊病例标本开展A组轮状病毒检测及阳性标本基因分型。


伯杰医疗密切关注RVA的监测工作,推出了A组轮状病毒分型系列试剂,覆盖G9P[8]、G2P[4]等国内主流型别,助力A组轮状病毒分型监测。


其中A组轮状病毒及基因分型核酸检测试剂盒(A+B预制板/荧光PCR法),根据荧光PCR技术原理,针对A组轮状病毒通用型以及G1、G2、G3、G4、G8、G9、G10、G12、P4、P6、P8、P9、P10、P11基因型设计引物探针,从而实现对A组轮状病毒及G型、P型的分型检测。A组轮状病毒及基因分型核酸检测试剂盒(A+B预制板/荧光PCR法)采用伯杰医疗特色的A+B预制分装包装,123三步完成加样工作,1min便捷手工操作,80min快速出结果,常规荧光定量PCR技术,轻轻松松完成A组轮状病毒分型检测。






参考文献


[1]全国病毒性腹泻监测方案(2021版).


[2]Crawford S E,e [J]. Nat Rev Dis Primers,2017,3(1): 17083. DOI: 10.1038/ nrdp. 2017. 83.


[3]DóróR,et al. [J]. Infect Genet Evol, 2014, 28: 446-461. DOI:10.1016/ j. meegid. 2014. 08. 017.


[4]Matthijnssens J,Van R M.[ J]. Curr Opin Virol,2012,2(4):426-433. DIO:10. 1016/ j. coviro. 2012. 04. 007.


[5]Bányai K,et al.[ J]. Vaccine,2012,30 ( Suppl.1):A122-A130. DOI: 10. 1016/ j. vaccine. 2011. 09. 111.


[6]熊光萍, 李丹地. [J]. 中华实验和临床病毒学杂志, 2022, 36(2):4.



关于伯杰医疗

上海伯杰医疗科技股份有限公司是一家致力于感染性病原体分子诊断试剂研发和应用,深耕于多重荧光PCR诊断试剂和痕量病毒二代测序试剂及相关服务的国家高新技术企业。公司围绕感染性病原体这一主线,从诊断试剂、诊断仪器、测序服务和医检所服务等多个面提供全套解决方案。公司秉承“勇于创新,质量为先”的方针,为医疗机构、疾控公卫、高校科研等合作伙伴提供优质产品与服务。

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