伯杰动态

引言   

近来全国性寒潮席卷我国大部分地区。气温骤降、天气多变的情况下，免疫力较弱的群体患病风险显著升高。多地疾控部门近期接连发布健康提示，轮状病毒、诺如病毒、札如病毒、星状病毒、肠道病毒等多种病原体引发的感染性腹泻，已正式进入发病高峰期。

而病毒的快速变异与复杂进化让精准获取全基因组成为诊断与防控的核心难题。已知诺如病毒包含GI-GX共10群40余种型别，轮状病毒有A-H 8个群(人易感 A/B/C )，腺病毒共A-G 7个亚属，110多个基因型别，这些病毒不仅亚型繁多，还存在频繁的重组与新发突变，而传统检测仅能覆盖少数常见型别。扩增子富集法依赖特异性引物，仅能扩增已知片段，面对多亚型共存或轮状病毒这类分段基因组时，极易丢失关键序列，导致基因组组装碎片化；同时，该方法对于罕见型别、新发变异株往往难以识别或漏检，漏检的变异株可能更具毒性、传播力或免疫逃逸能力，但是容易被忽视，如C组轮状病毒全球病例不足1%，但是香港已有报道C组轮状病毒致死病例。

液相杂交捕获技术恰好破解了这一困局：通过设计覆盖目标病毒全基因组的探针库，经生物素标记的探针与靶标区域特异性结合后，再借助链霉亲和素磁珠对探针捕获的目的片段进行富集。无论病毒如何变异，只要其序列与探针存在一定程度的互补性，就能被有效捕获，确保获得完整的基因组信息，这对于研究病毒的进化，监测罕见/新发变异株的出现至关重要。

伯杰推出基于液相杂交捕获原理，对常见的腹泻类病原，例如轮状病毒、诺如病毒、札如病毒、星状病毒、腺病毒等全基因组的富集试剂盒，捕获后的文库可直接进行 Illumina 平台或MGI平台测序。

实验流程示意图

√ 全基因组高覆盖：病毒全基因组序列覆盖度≥99%，确保基因组关键信息无遗漏；

√ 新发变异强适配：针对病毒新发变异株仍能高效富集全基因组，精准追踪变异动态；

√ 多平台无缝兼容：封闭液与扩增引物已完成多平台预混处理，可直接适配 Illumina TruSeq文库、华大单端 Barcode 文库及华大双端 Barcode 文库的靶向捕获实验；

√ 多病毒同步捕获：可同步富集多种目标病毒核酸，无需分批次实验。

对诺如病毒样本，使用二代测序平台，PE150读长，测300Mb数据量，分析样本基因组覆盖度≥99.99%，覆盖度结果如下：

对札如病毒样本，使用二代测序平台，PE150读长，测300Mb数据量，分析样本基因组覆盖度≥99.8%，覆盖度结果如下：

对腺病毒样本，使用二代测序平台，PE150读长，测300Mb数据量，分析样本基因组覆盖度≥99.87%，覆盖度结果如下：