病毒基因组二代测序

发布时间：2020-05-14 浏览次数：1924

上海伯杰医疗科技有限公司构建的病毒二代测序平台，样品通过特殊处理、痕量病毒基因文库的构建、深度测序和生物信息学分析等过程，大大提高样品中病毒核酸检测灵敏度和病毒全基因组覆盖率。针对病原体含量低的临床标本我公司建立了建库前富集和捕获平台，提高病毒数据量。如近期为一客户进行的登革病毒二代测序，收集的数据中病毒序列占93.9%，其中黄病毒属全基因组的覆盖率近100%，覆盖的序列数达350000条。

货号	产品名称	备注
FW-CX-201	病毒全基因二代测序（毒株）	按照每株病毒收费
FW-CX-201a	病毒全基因二代测序（临床标本）	按照每株病毒收费
FW-CX-202	细菌框架图二代测序（建库+测序）	按照每株细菌收费
FW-CX-202a	细菌框架图测序A类分析	按照每个原始数据收费
FW-CX-202b	细菌框架图测序B类分析	按照每个原始数据收费
FW-CX-203	细菌完成图测序＜7M（建库+测序）	按照每株细菌收费
FW-CX-203a	细细菌完成图测序＜7M（分析）	按照每个原始数据收费
FW-CX-204	细菌完成图测序＞7M（建库+测序）	按照每个标本收费
FW-CX-204a	细菌完成图测序＞7M（分析）	按照每个原始数据收费
FW-CX-210	病毒宏基因组测序-DNA病毒	按照每个标本收费
FW-CX-211	病毒宏基因组测序-RNA病毒	按照每个标本收费

病毒基因组二代测序特色介绍：

使用的仪器设备为ThermoFisher的Ion Torrent PGM工作平台或Ilumina的 Miseq DX平台，数据分析使用本公司生信人员搭建Pipeline，拼接病毒基因组使用的是业界主流软件基础上优化过的拼接方案，以denovo拼接为主；目前已经对A型流感病毒、B型流感病毒、肠道病毒A组、呼吸道合胞病毒、副流感病毒、呼吸道腺病毒、偏肺病毒、札如入病毒、猪冠状病毒、轮状病毒A组、登革病毒、基孔肯亚病毒、日本脑炎病毒、新布尼亚病毒、诺如病毒、麻疹病毒，风疹病毒，腮腺炎丙肝病毒等进行了测序，可以联系我公司销售专员索要相关的参考报告格式。

下面展示我公司出具测序报告的内容：

该标本为临床原始粪便标本，肠道通用试剂盒检测阳性，标本Ct值为:28.16。

下机数据的质量描述，包括下机数据统计和数据过滤两块内容。报告出示1个表4个图，包括数据过滤统计(Q20)、序列质量分布箱线图、碱基质量分布图、碱基分布图、GC含量分布图。